Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CatipB9EKE5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CatipB9EKE5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CatipB9EKE5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.53■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC27.52■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CatipB9EKE5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CatipB9EKE5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CatipB9EKE5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms