Protein–RNA interactions for Protein: B9EJX3

Gm9047, Predicted gene 9047, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9047B9EJX3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm9047B9EJX3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9047B9EJX3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms