Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apba1B2RUJ5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms