Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Otud4B2RRE7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms