Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp42B2RQC2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp42B2RQC2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp42B2RQC2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp42B2RQC2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp42B2RQC2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp42B2RQC2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp42B2RQC2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp42B2RQC2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp42B2RQC2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp42B2RQC2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp42B2RQC2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms