Protein–RNA interactions for Protein: B1B212

H60b, Histocompatibility antigen 60b, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60bB1B212 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60bB1B212 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60bB1B212 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60bB1B212 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60bB1B212 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
H60bB1B212 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H60bB1B212 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H60bB1B212 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H60bB1B212 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H60bB1B212 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H60bB1B212 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H60bB1B212 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60bB1B212 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60bB1B212 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60bB1B212 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H60bB1B212 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H60bB1B212 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H60bB1B212 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H60bB1B212 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H60bB1B212 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60bB1B212 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60bB1B212 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms