Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm436B1AVU6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms