Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ARID3CA6NKF2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms