Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Herc3A6H6S0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms