Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E8

Ttll6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll6A4Q9E8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttll6A4Q9E8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ttll6A4Q9E8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll6A4Q9E8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll6A4Q9E8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll6A4Q9E8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll6A4Q9E8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll6A4Q9E8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll6A4Q9E8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll6A4Q9E8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll6A4Q9E8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll6A4Q9E8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll6A4Q9E8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll6A4Q9E8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll6A4Q9E8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll6A4Q9E8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll6A4Q9E8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttll6A4Q9E8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttll6A4Q9E8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttll6A4Q9E8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttll6A4Q9E8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll6A4Q9E8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll6A4Q9E8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll6A4Q9E8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll6A4Q9E8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll6A4Q9E8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms