Protein–RNA interactions for Protein: A2VDH3

Lrrc38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc38A2VDH3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc38A2VDH3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc38A2VDH3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc38A2VDH3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc38A2VDH3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc38A2VDH3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc38A2VDH3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lrrc38A2VDH3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms