Protein–RNA interactions for Protein: A2AV25

Fibcd1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fibcd1A2AV25 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fibcd1A2AV25 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Fibcd1A2AV25 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms