Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm27029A2A4P4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 914.5 ms