Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VarsQ9Z1Q9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VarsQ9Z1Q9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VarsQ9Z1Q9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VarsQ9Z1Q9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VarsQ9Z1Q9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VarsQ9Z1Q9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VarsQ9Z1Q9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VarsQ9Z1Q9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VarsQ9Z1Q9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VarsQ9Z1Q9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VarsQ9Z1Q9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VarsQ9Z1Q9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms