Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z126

Pf4, Platelet factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pf4Q9Z126 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pf4Q9Z126 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1278 ms