Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb6Q9Z0T9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb6Q9Z0T9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb6Q9Z0T9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb6Q9Z0T9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb6Q9Z0T9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb6Q9Z0T9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb6Q9Z0T9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb6Q9Z0T9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb6Q9Z0T9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb6Q9Z0T9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb6Q9Z0T9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb6Q9Z0T9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb6Q9Z0T9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb6Q9Z0T9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb6Q9Z0T9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb6Q9Z0T9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb6Q9Z0T9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb6Q9Z0T9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb6Q9Z0T9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itgb6Q9Z0T9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itgb6Q9Z0T9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb6Q9Z0T9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Itgb6Q9Z0T9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Itgb6Q9Z0T9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Itgb6Q9Z0T9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb6Q9Z0T9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb6Q9Z0T9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb6Q9Z0T9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb6Q9Z0T9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb6Q9Z0T9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb6Q9Z0T9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb6Q9Z0T9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb6Q9Z0T9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb6Q9Z0T9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb6Q9Z0T9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb6Q9Z0T9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms