Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms