Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXND1Q9Y4D7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms