Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEU3Q9UQ49 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEU3Q9UQ49 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEU3Q9UQ49 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEU3Q9UQ49 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEU3Q9UQ49 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEU3Q9UQ49 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEU3Q9UQ49 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEU3Q9UQ49 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEU3Q9UQ49 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEU3Q9UQ49 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEU3Q9UQ49 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEU3Q9UQ49 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEU3Q9UQ49 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEU3Q9UQ49 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEU3Q9UQ49 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEU3Q9UQ49 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEU3Q9UQ49 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEU3Q9UQ49 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEU3Q9UQ49 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEU3Q9UQ49 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEU3Q9UQ49 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEU3Q9UQ49 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEU3Q9UQ49 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEU3Q9UQ49 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEU3Q9UQ49 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEU3Q9UQ49 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEU3Q9UQ49 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEU3Q9UQ49 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEU3Q9UQ49 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEU3Q9UQ49 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEU3Q9UQ49 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEU3Q9UQ49 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEU3Q9UQ49 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEU3Q9UQ49 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEU3Q9UQ49 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEU3Q9UQ49 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEU3Q9UQ49 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEU3Q9UQ49 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEU3Q9UQ49 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEU3Q9UQ49 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEU3Q9UQ49 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEU3Q9UQ49 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEU3Q9UQ49 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms