Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CYTH4Q9UIA0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYTH4Q9UIA0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms