Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CtsfQ9R013 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 246.2 ms