Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms