Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SpastQ9QYY8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SpastQ9QYY8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms