Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PnckQ9QYK9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PnckQ9QYK9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PnckQ9QYK9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PnckQ9QYK9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PnckQ9QYK9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PnckQ9QYK9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PnckQ9QYK9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PnckQ9QYK9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PnckQ9QYK9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PnckQ9QYK9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PnckQ9QYK9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PnckQ9QYK9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PnckQ9QYK9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PnckQ9QYK9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PnckQ9QYK9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PnckQ9QYK9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PnckQ9QYK9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PnckQ9QYK9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PnckQ9QYK9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PnckQ9QYK9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PnckQ9QYK9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PnckQ9QYK9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PnckQ9QYK9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PnckQ9QYK9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PnckQ9QYK9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PnckQ9QYK9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PnckQ9QYK9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PnckQ9QYK9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PnckQ9QYK9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PnckQ9QYK9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PnckQ9QYK9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PnckQ9QYK9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PnckQ9QYK9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PnckQ9QYK9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PnckQ9QYK9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PnckQ9QYK9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PnckQ9QYK9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PnckQ9QYK9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PnckQ9QYK9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms