Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxe3Q9QY14 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms