Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms