Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMOD3Q9NYL9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms