Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms