Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms