Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms