Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FBXO8Q9NRD0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms