Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFA1Q9NP55 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms