Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Edf1Q9JMG1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Edf1Q9JMG1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms