Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB8

Cntn6, Contactin-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn6Q9JMB8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntn6Q9JMB8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms