Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmx1aQ9JKU8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms