Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Riox1Q9JJF3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms