Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCLRE1BQ9H816 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms