Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLSTN2Q9H4D0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN2Q9H4D0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms