Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138 ms