Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snap29Q9ERB0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snap29Q9ERB0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snap29Q9ERB0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snap29Q9ERB0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snap29Q9ERB0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snap29Q9ERB0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snap29Q9ERB0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap29Q9ERB0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms