Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT5

Sdf2, Stromal cell-derived factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdf2Q9DCT5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdf2Q9DCT5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms