Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Swt1Q9DBQ9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Swt1Q9DBQ9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms