Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Med29Q9DB91 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms