Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB54

Fam216a, Protein FAM216A, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam216aQ9DB54 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam216aQ9DB54 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam216aQ9DB54 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam216aQ9DB54 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam216aQ9DB54 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam216aQ9DB54 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam216aQ9DB54 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam216aQ9DB54 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam216aQ9DB54 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam216aQ9DB54 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam216aQ9DB54 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam216aQ9DB54 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam216aQ9DB54 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam216aQ9DB54 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam216aQ9DB54 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam216aQ9DB54 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam216aQ9DB54 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam216aQ9DB54 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam216aQ9DB54 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam216aQ9DB54 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam216aQ9DB54 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam216aQ9DB54 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam216aQ9DB54 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam216aQ9DB54 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam216aQ9DB54 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam216aQ9DB54 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam216aQ9DB54 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam216aQ9DB54 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms