Protein–RNA interactions for Protein: Q9D920

Borcs5, BLOC-1-related complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs5Q9D920 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Borcs5Q9D920 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs5Q9D920 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs5Q9D920 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs5Q9D920 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs5Q9D920 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs5Q9D920 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs5Q9D920 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs5Q9D920 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs5Q9D920 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs5Q9D920 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs5Q9D920 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs5Q9D920 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs5Q9D920 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs5Q9D920 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs5Q9D920 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs5Q9D920 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs5Q9D920 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs5Q9D920 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs5Q9D920 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs5Q9D920 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms