Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slx4ipQ9D7Y9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slx4ipQ9D7Y9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Slx4ipQ9D7Y9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slx4ipQ9D7Y9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slx4ipQ9D7Y9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slx4ipQ9D7Y9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms