Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spns3Q9D232 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms