Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms