Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lsm12Q9D0R8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms