Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU3

Mtrex, Exosome RNA helicase MTR4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtrexQ9CZU3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MtrexQ9CZU3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MtrexQ9CZU3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MtrexQ9CZU3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MtrexQ9CZU3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MtrexQ9CZU3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MtrexQ9CZU3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MtrexQ9CZU3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MtrexQ9CZU3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MtrexQ9CZU3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MtrexQ9CZU3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
MtrexQ9CZU3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MtrexQ9CZU3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms